El Monasterio de La Concepción, edificado inicialmente a las afueras de la ciudad, se ubica en la actualidad en un lugar céntrico de la misma. . La fortuna de una hija de Estella, María Paula Aguirre y Gamarra, nacida en la típica plaza de San Juan, hizo posible su construcción. El convento estellés, hecho a imitación del de Ágreda, fue inaugurado en 1.731.
La fachada de la iglesia se dispone en tres cuerpos de altura desigual, rematada por frontón, en la primera mitad del siglo XVII y que obtuvo una amplia difusión a partir de la construcción del convento de la Encarnación en Madrid. La iglesia es de una sola nave de tres tramos con crucero saliente y cabecera recta. La cubierta es de bóveda de cañón con lunetos y media naranja sobre pechinas en el tramo central del crucero.